Auch dazu gibt es im Confluence eine Möglichkeit, wenngleich etwas versteckt.

Unter "General Configuration → Look and Feel → Custom HTML" hat man die Möglichkeit, einen entsprechenden Eintrag vorzunehmen. 
In der Rubrik "At end of the HEAD" muss man eintragen:

<script>
jQuery(document).ready(function() {
    jQuery(".external-link").attr("target", "_blank");
});
</script>

... das war´s schon.

Auf der Seite sieht das dann so aus: